Deoarece fiecare versiune de MS-DOS și Windows este diferită, multe dintre comenzile externe respectivele programe nu vor fi compatibile. Prin urmare, dacă doriți să utilizați o anumită comandă externă, va trebui să găsiți un utilitar de la o terță parte care vă oferă funcționalitatea.

Mulți indivizi și companii care au creat comenzi MS-DOS prin cablu pentru a îndeplini noi funcții. În plus, există unele programe capabile să realizeze sarcini care nu sunt în mod normal posibile cu nici o comandă MS-DOS. Efectuați o căutare pe orice motor de căutare popular pentru "linia de comandă", "descărcare" sau "ferestre" și o scurtă descriere a ceea ce căutați să faceți. De exemplu, căutarea "ferestrelor de comandă de editare a fișierelor de descărcare" va găsi editorii de linie de comandă Windows.

Notă: Unele comenzi pot funcționa dacă sunt copiate direct de pe un alt computer care execută versiunea de Windows sau MS-DOS care acceptă comanda pe computer. Cu toate acestea, acest lucru nu este recomandat din cauza problemelor de incompatibilitate, precum și a problemelor legale.